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免费下载硕士论文-布莱凯特肉牛H-FABP基因的序列测定与序列分析

  • 资源类别:论文
  • 资源分类:生物农医
  • 适用专业:动物遗传育种与繁殖
  • 适用年级:大学
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资料简介
硕士论文-布莱凯特肉牛H-FABP基因的序列测定与序列分析,共69页,37341字
摘要
【目的】:
心脏脂肪酸结合蛋白由心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因所编码,主要在畜禽
的心肌、骨骼肌和乳腺中表达。心脏脂肪酸结合蛋白( H-FABP) 基因是肌内脂肪的候选
基因,它能影响肌内脂肪( IMF) 的含量,对牛肉的肉质品质具有重要作用。本试验以布
莱凯特肉牛为研究对象,对其H-FABP基因进行测序和序列分析,为进一步开展布莱凯
特肉牛H-FABP基因与肉质性状的相关分析,进行标记辅助选择及基因定位研究提供理
论基础。
【方法】:
根据GenBank发表的牦牛心脏脂肪酸结合蛋白基因(H-FABP)的序列设计13对引物,
分13段扩增出布莱凯特肉牛H-FABP基因,对各个片段进行克隆测序,使用生物信息学
软件对各个片段的测序结果进行拼接,得到布莱凯特肉牛心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)
基因的全序列,同时进行序列分析,并对其基因的分子特性进行预测分析。使用MEGA
4.0软件进行系统进化树的构建。
【结果】:
布莱凯特肉牛的心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因(Genebank登陆号:FJ756345)是
由4个外显子(依次为73bp、173bp、102bp和54bp)和3个内含子(3463bp、1892bp和1494bp)
组成。其核苷酸编码序列(CDS)为402bp, 编码133个氨基酸。布莱凯特肉牛与牦牛、普
通牛、山羊、猪、马、人、大鼠、小鼠和鸡9个物种之间的同源性大小依次为99.3%、99.0%、
96.3%、92.5%、89.8%、88.3%、83.8%、82.8%、75.6%,其氨基酸的同源性为99.2%、
99.2%、96.2%、93.2%、91.7%、88.7%、86.5%、86.5%、77.4%。系统发生树将这些
物种总体上分成2支,鸡为独立的一支,布莱凯特肉牛、牦牛、普通牛、山羊、猪、马、
人、大鼠、小鼠为另一独立的大分支。
【结论】:
1. 布莱凯特肉牛的心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因是由 4 个外显子(依次为
73bp、173bp、102bp 和 54bp)和 3 个内含子(3463bp、1892bp 和 1494bp)组成。其核苷
酸编码序列(CDS)为 402bp, 编码 133 个氨基酸。
2. 布莱凯特肉牛与牦牛心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因全序列比较发现有 41
处碱基的变化。并且在内含子部分有碱基的插入 和缺失, 1415、1628、1808、2441
和 3436 各位点后出现了碱基的插入(插入的碱基分别为 T、C、A、A 和 A),852、2444、
7043 位点出现了碱基的缺失(缺失的碱基分别为 A、G、G)。
3.布莱凯特肉牛与牦牛和普通牛相比,在氨基酸序列 50 位处发生了氨基酸的变异,
布莱凯特肉牛为异亮氨酸,牦牛和普通牛为缬氨酸,这是由其编码核苷酸序列 148 处
(G→A)产生的,造成了布莱凯特肉牛与牦牛和普通牛在氨基酸水平上的差异。
4. 分析 10 个物种核苷酸和氨基酸的同源性,分别介于 75.6%-99.3%和 77.4%-99.2%
之间,表明 H-FABP 基因和氨基酸序列保守性较高。系统发生树将这些物种总体上分成
2 支,鸡为独立的一支,布莱凯特肉牛、牦牛、普通牛、山羊、猪、马、人、大鼠、小
鼠为另一独立的大分支,符合物种进化规律。
关键词:布莱凯特肉牛;H-FABP 基因;序列测定;序列分析
目录
中文摘要………Ⅰ
英文摘要………Ⅲ
英文缩写词表…Ⅴ
前言…………… 1
第一部分 文献综述…………3
1 国内外肉牛的研究情况……… 3
1.1 我国肉牛的研究现状………3
1.1.1 我国肉牛业概况…………3
1.1.2 国内肉牛分子遗传育种情况………………4
1.1.3 国内肉牛业存在的一些问题………………5
1.2 国际肉牛业的发展…………6
1.3 布莱凯特肉牛简介…………6
2 脂肪酸结合蛋白的研究进展…7
2.1 脂肪酸结合蛋白的发现……7
2.2 脂肪酸结合蛋白家族概述…7
2.3 脂肪酸结合蛋白的功能和生理性能…………7
3 心脏脂肪酸结合蛋白基因……9
3.1 心 脏脂肪酸结合蛋白基因概述……… 9
3.2 心脏脂肪酸结合蛋白基因及其定位…………9
3.3 心脏脂肪酸结合蛋白基因对肉质的影响……10
3.4 心脏脂肪酸结合蛋白基因研究前景及意义…11
4 生物信息学及其研究现状……11
4.1 生物信息学的概念…………11
4.2 生物信息学的发展简介…12
4.3 生物信息学的研究内容……12
4.3.1基因组学和蛋白组学的研究12
4.3.2 生物数据库和软件的研究13
4.3.3 分子进化和比较基因组的研究……………13
4.4 生物信息学在畜禽基因组研究中的应用……13
4.4.1 结构基因组学在畜禽基因组研究中的应用14
4.4.2 比较基因组学在畜禽基因组研究中的应用15
4.4.3 功能基因组学在畜禽基因组研究中的应用15
试验一 布莱凯特肉牛 H-FABP 基因的扩增……16
1 材料与方法…16
2 结果与分析…20
3 讨论…………23
试验二 目的基因的克隆与序列测定…………26
1 材料与方法…29
2 结果与分析…29
3 讨论…………30
试验三 布莱凯特肉牛 H-FABP 基因的序列分析32
1 材料与方法…32
2 结果与分析…33
3 讨论…………39
结论…………41
参考文献………42
附录……………46
致谢……………54
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