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蜜蜂与桃蚜烟碱乙酰胆碱受体的同源模建及分子对接，硕士学位论文，共81页。
摘 要
烟碱乙酰胆碱受体 (nicotinic acetylcholine receptor, nAChR)是介导传递突触间快速信息的配体门控离子通道蛋白，主要存在于脊椎动物和昆虫的中枢神经系统中，同时它也是新烟碱类杀虫剂的作用靶点。近年来，新烟碱类杀虫剂的发展较快，已占杀虫剂市场的 50%左右，但新烟碱类杀虫剂对蜜蜂的安全问题越来越受到重视。为了探究吡虫啉分子对蜜蜂和桃蚜 nAChR 作用模式的异同点，找出其作用于 nAChR 的关键部位，本研究以计算机辅助药物设计技术为基础，分别构建了蜜蜂(α1)2(β1)3型和桃蚜(α2)2(β1)3型 nAChR。经过拉氏图、分
子动力学模拟和 RMSF 图等实验方法对构建模型的合理性进行了验证。将吡虫啉与蜜蜂(α1)2(β1)3型 nAChR 和桃蚜(α2)2(β1)3型 nAChR 进行分子对接,  讨论了吡虫啉分子与两者对接结果的相似性和差异性。对接打分Cscore 值与结合自由能较为吻合，说明了对接打分的合理性。结果显示，尽管吡虫啉对两者均有较强的毒性，但作用机制却不尽相同。其硝基部分在对接中起到了关键作用，是吡虫啉对两模建受体无明显选择性作用的主要原因，同时也从理论上阐明了吡虫啉的使用危害到了蜜蜂群体的生存。随后将另外六个新烟碱类也进行了对接，
结果表明六种化合物与桃蚜 nAChR 的结合较为稳定，打分较高；对蜜蜂 nAChR而言，烯啶虫胺、噻虫胺、噻虫啉的作用效果较为明显，而啶虫脒、噻虫啉、呋虫胺对蜜蜂 nAChR 的作用效果较弱。这一结论与新烟碱类的实际使用情况和相关测试结果基本一致。 
关键词：蜜蜂(α1)2(β1)3型 nAChR, 桃蚜(α2)2(β1)3型 nAChR, 新烟碱类杀虫剂,吡虫啉, 同源模建, 分子对接

目 录
摘 要 I
Abstract III
引 言 1
第 1 章 烟碱乙酰胆碱受体与新烟碱类杀虫剂 3
11 烟碱乙酰胆碱受体 3
111 简介 3
112 烟碱乙酰胆碱受体和乙酰胆碱蛋白研究 5
12 新烟碱类杀虫剂 6
121 简介 6
122 新烟碱类的市场占有情况 7
123 适用范围和对象 8
124 吡虫啉的问世 10
125 吡虫啉使用带来的危害 11
13 近年来国内开发的新型新烟碱类化合物 12
第 2 章 生物信息学与药物研发现状 17
21 数据资源相关介绍 17
211 小分子数据库 17
212 生物学数据库 18
22 新药研发 20
23 药物仿制 21  
第 3 章 计算机辅助药物设计介绍 23
31 计算机辅助药物设计的出现 23
32 CADD 主要软件的介绍 24
321 SYBYL 的简要介绍 24
322 其它主要药物设计软件介绍 27
33 通过计算机辅助药物设计开发出的的新药实例 28
34 计算机辅助药物设计的实验方法 29
341 间接药物设计 29
342 直接药物设计 30
第 4 章 蜜蜂与桃蚜烟碱乙酰胆碱受体的同源模建 33
41 引言 33
42 模建步骤 34
43 序列比对与构建模型的结果与讨论 36
第 5 章 新烟碱类化合物以及环氧啉的分子对接 47
51 引言 47
52 对接方法 47
53 对接结果与讨论 49
531 吡虫啉分子的对接结果 49
532 其它新烟碱类化合物的对接结果 55
54 环氧啉与蜜蜂、桃蚜受体的分子对接 57
第 6 章 结 论 61
参考文献 63
公开发表论文 71
致谢 73